Hamburg, Herbst 2019: Die junge Ärztin Isabella überzeugt ihren Bruder aus der Favela Rios, in der beide aufgewachsen sind, zu ihr nach Deutschland zu kommen. Zunächst läuft alles nach Plan, Gabriel findet einen Job und verliebt sich in seine Kollegin. Doch dann verschwindet er spurlos. Für Isabella beginnt eine verzweifelte Suche in einem Land, das ihr immer fremder wird.
Zur gleichen Zeit versucht der Pfleger Fabio, sein unauffälliges Leben weiterzuführen, bis er nicht mehr ignorieren kann, was in seinem Gästezimmer liegt: eine seit Monaten verwesende Leiche.

Alexander Rupflin rekonstruiert in seinem Debütroman einen der am aufsehenerregendsten Kriminalfälle der Gegenwart, indem er eintaucht in das Leben der Angehörigen und eines Serientäters, der an seine Unschuld glaubt.
'Protokoll eines Verschwindens' ist eine Geschichte vom Streben nach Glück, der Suche nach Wahrheit, dem Gefühl der Verlorenheit und den Abgründen unserer Triebe.